模式种（英语：Type species）是生物分类学上的一个名词。
被首次发现，且被描述并发表的物种定为模式种。
是用来代表一个属或属以下分类群的物种，严格来说，模式种一词只用于动物分类学上。
在植物分类学中，包括属与种在内，皆是由标本或绘图来做代表，称为模式标本，“模式种”在植物分类上，则是一个非正式的称呼。