肠道菌群
在人身体的体表及其与外界相通的腔道， 如口腔、 鼻腔系统、 咽喉腔、 眼结合膜、 肠道及泌尿生殖道等部位都有大量的微生物的存在， 其中一部分为长期寄居的微生物， 在机体防御机能正常时是无害的， 称为正常菌群或正常微生物群。 正常菌群对人体有益无害， 而且是必须的。 正常菌群是由相当固定的细菌组成， 有规律地定居于身体一些特定部位， 成为身体的一个组成部分。 正常菌群数量是巨大的， 大约为1014个左右， 在长期的进化过程中， 通过个体的适应和自然选择， 正常菌群中不同种类之间， 正常菌群与宿主之间， 正常菌群、 宿主与环境之间， 始终处于动态平衡状态中， 形成一个互相依存， 相互制约的系统， 因此， 人体在正常情况下， 正常菌群对宿主表现不致病。
除正常菌群外， 还有一种称为过路菌群， 又称外籍菌群， 是由非致病性或潜在致病性细菌所组成， 来自周围环境或宿主其它生境， 在宿主身体存留数小时，数天或数周， 如果正常菌群发生紊乱， 过路菌群可在短时间内大量繁殖， 引起疾病。
正常菌群有许多重要的生理功能：1、 如菌群之间生物的拮抗作用， 正常菌群在人体某一特定位粘附，定植和繁殖，形成一层菌膜屏障。通过拮抗作用，抑制并排斥过路菌群的入侵和群集，调整人体与微生物之间的平衡状态。2、免疫作用，正常菌群能刺激宿主产生免疫及清除功能。 3、排毒作用，如双岐杆菌能使肠道过多的革兰氏阴性杆菌下降到正常水平，减少内毒素的吸收。4、抗肿瘤作用，能降解、清除体内的致癌因子，激活体内的抗肿瘤细胞因子等。 5、抗衰老作用等。
肠道菌群除了上述以上功能之外，对人体还有营养作用，人体肠道的正常微生物，如双岐杆菌，乳酸杆菌等能合成多种人体生长发育必须的维生素，如B族维生素（维生素B1、B2、B6、B12），维生素K，烟酸、泛酸等，还能利用蛋白质残渣合成非必需氨基酸，如天冬门氨酸、丙氨酸、缬氨酸和苏氨酸等，并参与糖类和蛋白质的代谢，同时还能促进铁、镁、锌等矿物元素的吸收。这些营养物质对人类的健康有着重要作用，一旦缺少会引起多种疾病。如糖尿病、高血压、高血脂等。B族维生素和非必需氨基酸对人类的毛发具有重要的作用，当缺少这些营养元素，会导致头发脱落或毛发发黄、发叉，容易折断等现象。
人类与微生物之间的动态平衡称为微生态平衡，影响其微生态平衡的因素有外环境因素，也有宿主因素，外环境主要是通过改变宿主的生理功能产生的，如正常菌群，通过产生细菌素，抗生素和其代谢产物，以及争夺营养，空间争夺以阻止过路菌群入侵，保持自身的稳定性。生态平衡时，可以保持宿主的正常生理功能，如营养、免疫、消化等。生态失调可因慢性病，癌症，手术，辐射感染，抗生素不合理应用等引起。
对肠内微生态失衡者，可以直接补充双歧杆菌，或者补充膳食纤维，都可以达到同样的效果。
肠道菌群和便秘之间的关系：
一个健康的肠道是和里面有益的肠道菌群密不可分的。 在健康条件下， 肠内菌群中的有益菌占优势， 其代表如双歧杆菌、 乳杆菌等。 正常粪便含有70—80%的水份， 这些水份的保持就得益于肠内菌群的附着和存在。 所以维持身体的健康， 保持肠内有益菌占优势是十分必要的。
如果在肠道中没有肠道菌群（ 比如吃了抗生素把肠道菌群大部分都杀死了 ）， 粪便中也就没有了菌群和水份的完美结合， 粪便又干又硬~~~~~~~~ 便秘就在所难免了~~~~~~~~~~~~
肠道菌群是如何分布的？[1]
健康人的胃肠道内寄居着种类繁多的微生物，这些微生物称为肠道菌群。在人类胃肠道内的细菌可构成一个巨大而复杂的生态系统，一个人结肠内就有400个以上的菌种。
从口腔进入胃的细菌绝大多数被胃酸杀灭，剩下的主要是革兰氏阳性需氧菌。胃内细菌浓度<10 3 CFU/ML（CFU即colony forming unit菌落形成单位）。
小肠菌全的构成介于胃和结肠之间。近端小肠的菌丛与胃内相近，但常能分离出大肠杆菌和厌氧菌。在远段回肠，厌氧之间。
近端小肠的菌丛与胃内相近，但常能分离出大肠杆菌和厌氧菌。
远段回肠，厌氧菌的数量开始超过需氧菌，其中大肠杆菌恒定存在，厌氧菌如类杆菌属、双歧杆菌属、梭状芽胞杆菌属，都有相当数量。
在回盲瓣的远侧，细菌浓度急剧上升，结肠细菌浓度高达10.11 ～10.12 CFU/ml，细菌总量几乎占粪便干重的1/3。其中厌氧菌达需氧菌的10.3 ～10.4 倍。主要菌种为粪杆菌属、双岐杆菌属和真杆菌属。