高立志
高立志,男,1968年6月生,理学博士学位,研究员,博士生导师。
教育经历:
1987年9月-1991年7月 云南大学生物系植物学专业学习,获得理学学士学位
1991年8月-1994年7月 云南大学生物系植物学专业学习,在胡志浩教授指导下获得理学硕士学位,从事于禾本科植物的分类,系统与进化研究
1994年8月-1997年7月 中国科学院植物研究所系统与进化植物学重点实验室学习,在洪德元院士指导下获得理学博士学位,从事于中国野生稻的群体遗传学和保护生物学研究
工作经历:
1997年8月-1999年9月 在中国农业科学院作物品种资源研究所作物种质资源与生物技术重点实验室董玉琛院士指导下作博士后研究
1998年8月- 9月 在国际水稻研究所作访问科学家 (水稻生物多样性的保护和基因库管理)
1998年8月- 任云南农业科学院客座研究员
1999年10月- 任中国农业科学院作物品种资源研究所稻种资源研究室副研究员
1999年11- 2000年11月 被联合国粮农组织下属的国际植物遗传资源研究所(IPGRI)授予Vavilov-Frankel Fellow,赴美国华盛顿大学(圣路易斯)生物学系在美国科学院副院长, Barbara A. Schaal 院士指导下作博士后研究
2000年11月 - 2002年6月 在美国佐治亚大学遗传学系作博士后研究,合作导师为Susan Wessler 院士和John F. McDonald教授
2002年7月 - 2003年6月 在美国密西根大学(Ann Arbor) 生态与进化生物学系任Research Fellow,合作导师为Jianzhi George Zhang 博士
2003年7月- 2004年12月 在美国德克萨斯大学休斯顿分校的人类遗传学中心任Research Fellow,合作导师为 Hideki Innan 博士
2005年1月- 2006年4月 在美国休斯顿大学生物与生物化学系任研究助理教授Research Assistant Professor
2006年5月-2007年5月 在美国德克萨斯大学奥斯丁分校分子细胞与发育生物学系任研究科学家(Research Scientist)
2006.6-至今 中国科学院昆明植物研究所,教授,博士生导师,中国西南国家种质资源库植物种质资源与基因组学中心主任
研究领域:
从基因组的进化,基因功能与表达的生态适应到栽培植物的起源,驯化与基因组水平上的人工选择,我对进化基因组学,比较功能基因组学,生态基因组学和种质基因组学有着广泛而浓厚的研究兴趣。利用基因组学,生态学和生物信息学的方法,我的研究涵盖了分子进化,理论群体遗传学,分子生态学和保护生物学等诸多领域。近年来,通过理论模型建立,原始实验数据收集,计算生物学分析,野外生态学调查和植物遗传资源育种利用等理论与方法相结合,我一直利用全基因组的DNA序列,蛋白质组和基因表达数据,以水稻,拟南芥,杨树,小麦,人,老鼠,石斑鱼和酵母菌等重要模式生物及其近缘基因组为研究对象,旨在探讨进化生物学,生态学与保护生物学中的重要科学问题;并以“全基因组中的基因功能注释—发育—形态建成” 与“全基因组中的基因功能注释—表达—生态适应”为导向,探索野生植物种质资源优异新基因的发掘与有效利用的新思路。
目前,他领导的植物进化,生态,比较功能基因组学与生物信息学研究组正在如下领域从事研究:
1)水稻、茶树和其它重要作物基因组的起源,驯化,人工选择和居群进化历史;
2)禾本科和山茶属植物的比较功能基因组学与基因组进化;
3)水稻、小麦、拟南芥、杨树和茶树等及其近缘植物基因组的多倍体进化;
4)植物基因重复后基因丢失与保留、基因转换和基因功能与表达分化的进化机制;
5) 植物转座子对基因结构、表达、功能与进化的影响及其在基因进化中的生态适应与选择;
6)通过全基因组中植物转座子与基因重复的增减来研究植物基因组大小变异、结构复杂性与进化;
7)植物基因组中非编码DNA的适应性进化;
8)植物基因组中microRNA 与其靶基因的鉴定及其适应性进化;
9)植物基因组中具有重要功能的基因家族的分子进化及其在青藏高原的极端生境(十字花科、禾本科和杨柳科)和热带、亚热带的复杂生态系统(山茶科)等居群中的适应性进化;
10)野生稻、野茶树等重要作物野生近缘的保护与种质基因组学;
11)水稻(包括其它重要代表性禾本科植物)、茶树及其野生近缘的DNA库及其基因组指纹数据库的建立。
获奖情况:
1997年起多次获得国际基金会 (IFS)荣誉研究基金;1999年获得联合国粮农组织下属的国际植物遗传资源研究所(IPGRI)授予的Vavilov-Frankel Fellow;2008年入选中国科学院“百人计划”。
主持和参加项目:
1)主持完成国际科学基金会(IFS),国际植物遗传资源研究所(IPGRI),中国自然科学基金会青年基金项目和中国科学院重大项目子专题;参加完成国家“973”重大项目子专题两项,中国科学院分类与区系特别资助项目和中国科学院院长基金;参加完成美国NIH,NSF和USDA资助的研究项目多项。
2) 目前主持中科院方向性重点项目1项,参加中科院方向性重点项目1项,参加国家“973 ” 重大项目1项,主持2006年中科院“百人计划”项目。
近期发表的代表论文:
以第一作者或通讯联系人在Science,Trends in Genetics, Genetics, Molecular Ecology,TAG 等国际刊物上发表论文40 余篇,科学贡献已经得到国际同行的高度认可。近期发表的代表论文为:
Gao L. Z.*, Hideki Innan. 2008. Non-independent domestication of the two rice subspecies, Oryza sativa subsp. indica and subsp. japonica, demonstrated by multilocus microsatellites. Genetics (in press)
Gao L. Z.*, Hongyan Xu. 2008. Patterns of mutation rate variation at microsatellites: evolutionary insights from comparisons of Asian cultivated rice (Oryza sativa L.) and related species. BMC Evolutionary Biology 8:11
Gao L. Z.* 2005. Microsatellite diversity and population genetic structure of an endangered wild rice, Oryza officinalis (Poaceae) from China. Molecular Ecology 14: 4287-4297
Gao L. Z., Hideki Innan. 2004. Very low gene duplication rate in the yeast genome. Science 306: 1367-1370
Gao L. Z.*, McCarthy E. M., Gankgo E., McDonald J. F. 2004. Evolutionary history of Oryza sativa LTR retrotransposons: a preliminary survey of the rice genome sequences. BMC Genomics 5: 1-1
Gao L. Z.* 2004. Population structure and conservation genetics of wild rice Oryza rufipogon (Poaceae): a region-wide perspective from microsatellite variation. Molecular Ecology 13(5): 1009-1024
Gao L. Z., Zhang J. Z. 2003. Why human disease-associated mutations are identical in orthologous sites of healthy mouse? Trends in Genetics 19(12): 678-681
McCarthy E. M., Liu J. D., Gao L. Z., McDonald J. F. 2002. Long terminal repeat retrotransposons of Oryza sativa. Genome Biology 3(10):research0053.1-0053.11
Gao L. Z.*, Schaal B. A., Zhang C. H., Jia J. Z., Dong Y. S. 2002. Assessment of population genetic structure of common wild rice Oryza rufipogon Griff. detected by microsatellite DNA and allozyme loci. Theoretical and Applied Genetics 106: 173-180
参加国际学术活动的情况:
作为荣誉会员应邀参加American Association for the Advancement of Science和Sigma Xi (Senior Membership);作为American Society of Botany,Society for Molecular Biology and Evolution,The Society for the Study of Evolution,American Genetic Association和Society for Conservation Biology等5个学会会员。
迄今为止,常年为如下20个国际刊物审阅稿件,包括PNAS, Genome Research, Gene, Genome Biology, BMC Genomics, Molecular Biology and Evolution, Evolution, BMC Evolutionary Biology, BMC Genetics, New Phytologist, Molecular Ecology, Journal of Molecular Evolution, Genetica, Conservation Genetics,FEBS Letters, Plant Systematics and Evolution, Theoretical and Applied Genetics, Euphytica, Plant Genetic Resources: Characterization & Utilization 和 Journal of Heredity。任The Open Conservation Biology Journal的编委。