新疆大学学报编辑部现主办以下5种刊物，分别是《新疆大学学报》（汉文社会科学版）、《新疆大学学报》（汉文自然科学版）、《新疆大学学报》（维文自然科学版）、《新疆大学学报》（维文社会科学版）、《新疆大学学报》（哈文综合版）