农业生态系统监测是对人类社会经济活动造成的农业生态系统的变化及其影响的推测。其主要内容有：水土流失的面积、强度、分布及其危害；盐碱土或腌渍土的面积、分布及变化趋势；沙漠化的发展趋势；耕地数量和质量的变化情况；大气污染、水污染、固体废物及化肥、农药等对土壤、农作物的产量和品质的影响情况；农村能源结构的发展方向等。预测的目的在于维持农业生态系统的平衡，促进农业生产的持续发展。