拉氏构象图

王朝百科·作者佚名  2010-05-08  
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拉氏构象图:

Ramachandran根据蛋白质中非键合原子间的最小接触距离,确定了哪些成对二面角(Φ、Ψ)所规定的两个相邻肽单位的构象是允许的,哪些是不允许的,并且以Φ为横坐标,以Ψ为纵坐标,在坐标图上标出,该坐标图称拉氏构象图(The Ramachandran Diagram)。可用来鉴定蛋白质构象是否合理。

⑴实线封闭区域

一般允许区,非键合原子间的距离大于一般允许距离,此区域内任何二面角确定的构象都是允许的,且构象稳定。

⑵虚线封闭区域

是最大允许区,非键合原子间的距离介于最小允许距离和一般允许距离之间,立体化学允许,但构象不够稳定。

⑶虚线外区域

是不允许区,该区域内任何二面角确定的肽链构象,都是不允许的,此构象中非键合原子间距离小于最小允许距离,斥力大,构象极不稳定。

Gly的Φ、Ψ角允许范围很大。

总之,由于原子基因之间不利的空间相互作用,肽链构象的范围是很有限的,对非Gly氨基酸残基一般允许区占全平面的7.7%,最大允许区占全平面22.5%。

 
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