前胸腺细胞在胸腺微环境中逐渐发育成熟，在次过程中，约有95％的细胞发生凋亡。T细胞抗原受体（TCR）基因发生重排时，基因某一连接点上发生基因无意义突变，不能产生或者产生不正确的TCR分子，细胞即走向凋亡；即使产生正确的TCR分子，细胞还必须经过进一步的严格选择机制，使可能导致自身免疫性疾病的细胞凋亡。