简约性信息位点

王朝百科·作者佚名  2010-05-16  
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简约性信息位点(parsimony-informative site)指基于DNA或蛋白质序列、利用最大简约法构建系统发育树时,在两个及以上分类单元(的序列)中存在差异,且每个状态至少出现两次的位点。所有分类单元中状态恒定的位点和只出现一次的变异的位点都是非简约性信息位点。

例如,对于4个物种(a、b、c、d)的如下4条DNA序列:

a ACGGT

b ACCGT

c AGACT

d AGTAA

其中,位点2发生了一次突变,且出现在两个物种中,因此是简约性信息位点。位点1在四个物种中完全一致,为保守性位点。位点3每种核苷酸状态只出现一次,位点4发生两次突变但分别只出现一次,位点5只在d物种发生一次突变,因此这几个位点虽然是变异位点,但都是非简约性位点。

 
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