南京航空航天大学高新技术研究院
南京航空航天大学高新技术研究院成立于2004年7月，同年9月正式挂牌运行。 2005年7月正式启动组建工作。高新院是以重大基础研究、应用基础研究和新型交叉学科高层次人才培养为主的专业科学研究实体，旨在培育学校未来重大科学研究领域，促进新型交叉学科的形成与发展，开拓学校重大航天研究领域，形成基础研究领域重大标志性原创性成果。
高新院下属三个研究机构，分别是纳米科学研究所，仿生结构与材料防护研究所，和微小卫星工程技术研究中心。
纳米科学研究所主要研究领域为分子物理力学、纳机电和纳智能系统、全寿命安全保障、微智能测控及其在空天飞行器中的应用。近年在纳智能系统，纳器件原理设计和能量转换、能量耗散、驱动原理等研究方面做出一系列创新工作，有望建成具有国际先进水平和国际影响力的、特色鲜明的交叉前沿科学研究基地。
仿生机构与材料防护研究所主要开展生物和仿生无障碍机器人、轻质高强耐损伤仿生材料和减摩耐磨表面仿生和技术的研究，发展至今，在国内仿生科学和技术领域已经成为领军团队之一，为提升我校在基础研究方面，特别是交叉学科领域的核心竞争力起到了重要的带头作用。
微小卫星工程技术研究中心是在飞行器设计、力学、信息与通信工程、计算机、自动控制等多个学科、专业的基础上组成的跨学科研究单位，主要开展微小卫星及扩展平台的研制工作。该中心主要从事微小卫星的研究与开发，通过微小卫星的研制带动南京航空航天大学航天领域的科学研究与高层次人才培养，推动航天相关学科的建设与发展，并具有承担国家航天领域重大项目的能力和为航天科技服务的能力。
研究院的建设目标：探索科研与高层次人才培养、组织与管理的新模式，以良好的运行机制和优惠政策为保障，以重点学科、科技创新平台为依托，以学科带头人与首席科学家为核心，围绕前沿性研究和重大项目凝聚学术队伍，形成若干个优秀创新团队，培育新兴交叉学科，支持鼓励优秀团队和人才在关键领域取得重大标志性成果，从而提高学校的科技创新能力和核心竞争力。