卢卡里欧
梦幻与波导的勇者
剧情：很久很久以前，有一个很远的地方……
那是被烟雾所笼罩的Orudoran大陆，鲁卡力欧站在巨岩上，山谷间空无一人，凤王高高飞过它的头顶，鲁卡力欧闭上了眼睛，它的心灵视线穿过岩石和群山，看见穿着红色与绿色盔甲的两支拥有人类步兵与精灵的大军正向山谷中相对开进，鲁卡力欧走到地面的一块结晶石前，向Orudoran城堡中的艾伦汇报。艾伦知道现在除了用最后的方法结束双方的战斗外已经别无选择，照这个速度发展下去，战争很快会威胁到神圣的“创始之树”。于是艾伦跳上比雕，向山谷的方向飞去。
艾伦就找到鲁卡力欧。他告诉它他现在必须前往“创始之树”，以保护这个星球免受战争的摧残。对艾伦无比忠诚的鲁卡力欧希望一同前去，然而艾伦却抛出权杖，将鲁卡力欧化作能量吸进顶端的宝石中。被留下的鲁卡力欧在宝石里眼睁睁地看着艾伦远去，而就在这时，两支军队在山谷中展开了惨烈的搏斗……
此时凤王回到了“创始之树”上，变回了它的原形——梦幻。那棵树突然开始发出绿色的辉光，绿光笼罩着这片大地，终于让交战的双方敬畏地停止了战斗。神奇的光线让他们认识到自己这样做最终只会给世界带来灾难，于是两支军队决定休战，他们离开了战场，从此再也没有爆发过战争。没有人知道在艾伦身上发生了什么，只有被认为是封印着鲁卡力欧的权杖被后人找到……
一位母亲对她的女儿讲述着这个故事。在一个现在就毗邻着Orudoran城堡的小镇里，这仅仅是一个童话而已。
梦幻与波导的勇者-鲁卡利欧
向战斗边疆旅行的小智一行来到了Orudoran城堡，这里的人都穿着欧洲中世纪（文艺复兴时期）的服装。在城堡内小智一行也打扮得与这里的人一样，前往即将举行的比武大赛。小智入城的时便有一只拥有变身能力的精灵时常变成不同的形态跟着他们 。小智打败重重对手进入决赛，决赛的对手是一个身着骑士铠甲的训练师。小智再次派出皮卡丘，对手派出了玛狃拉。在十万伏特与阴影球的激烈碰撞下，比赛落下帷幕，皮卡丘取得了最终的胜利。
小智走向对面的训练家与他握手，当那个训练家摘下的头盔后，却让大家大吃一惊，盔甲下竟然是一个女孩子，自我介绍她名叫琪朵。这时女王艾琳宣布下面将会为冠军“波导的勇者”举办一场盛大的舞宴。
晚会上，艾琳将“波导的勇者”的象征——“艾伦的权杖”颁给小智。一瞬间小智似乎听到了什么声音在哭喊，但由于别人都说没听见，小智也就不再在意。大家在尽情跳舞，那只精灵变身成长尾猴带着小智与小遥的精灵们去参观城堡，在阁楼上和大家一起兴高采烈地玩起来。
琪朵支开小刚，悄悄地跑向了精灵们离开的方向，喵喵在后面跟踪她，跟到一半从倾斜的屋顶上掉了下来，正好掉到玩耍中的精灵们旁边，那只精灵变回了原型——梦幻，去查看喵喵有没有受伤。小胜也注意到精灵们都不见了，直到看见刚比兽过来端了一盘水果到楼上去，于是跟着它一起到了顶楼。
琪朵放出两只玛纽拉，它们迅速对梦幻展开攻击，被梦幻轻松地避开，两只玛纽拉放出暴风雪，几乎将屋内的精灵全部冻住，皮卡丘使用雷电挡住玛狃拉的阴影球，却被产生的爆炸击昏过去。小胜把冻锢的门弄开了一条缝，惊讶地看见变回原型的梦幻，使用瞬间移动带着皮卡丘与喵喵一起消失。
舞会厅中，这时艾琳宣布进入庆典的下一个环节，女佣珍妮指着艾伦的画像让小智摆出英雄般的姿势。小智依言把权杖举过头顶，突然权杖上的宝石发出白光，巨大的作用力让小智几乎握不稳权杖，一只精灵从杖中被释放了出来！在场的人都惊呆了——那正是传说中被封印在杖内的精灵，鲁卡利欧！
鲁卡力欧以波的能量来感觉事物，却把小智当成了艾伦，小智解释说它是弄错人了，鲁卡力欧惊愕地睁开眼睛，它被身边的事物彻底混乱了。艾琳安慰了鲁卡利欧，向小智他们讲述了那个古老的传说。可能是小智和艾伦有着非常接近的波长，才会让鲁卡力欧的感知弄错。小胜跑过来告诉众人他刚刚看到的事情，琪朵也急匆匆地跑来，说她还看到它们向“创始之树”飞去。艾琳带着小智来到可以眺望那棵大叔的平台上，解释说这棵树具有超乎想象的治疗的力量，可以使大地恢复生机，还能平息愤怒的心，完成这一切还需要另一个生命的配合，精灵的起源——梦幻！小智一行人决定前往创始之树。琪朵用她的吉普车送他们，鲁卡利欧却在车前飞奔。
夜幕降临，大家停下来休息。小智说明天他一定要找回皮卡丘，鲁卡力欧有点困惑，或许是它觉得既然小智和艾伦那么相似，就也会像艾伦抛弃它那样弃皮卡丘于不顾。小智被鲁卡力欧惹恼了，和它扭打起来，在其他人赶到后鲁卡力欧把小智扔开，愤怒地想人类都是邪恶的生物，就像让它凉透了心的艾伦那样。小智看着鲁卡力欧走开，觉得自己可能有些过激了。
深夜，梦幻和皮卡丘又在嬉闹，但皮卡丘却仍然无法抑制对小智的思念。小智忽然觉得听到了皮卡丘的声音，从睡梦中惊醒过来。他走出吉普车，看到鲁卡力欧倚在一块岩石上。小智劝鲁卡力欧要多看事物光明的一面，又讲起自己与皮卡丘初遇时的故事。小智告诉鲁卡力欧他和皮卡丘之间是朋友般的感情，鲁卡力欧却觉得艾伦是自己的主人，一直作为仆从的它无法理解和人类做朋友是怎样的概念。
次日众人到达了当年艾伦把鲁卡利欧封进权杖的地方，鲁卡利欧无意间踢到了一朵时间之花，重现了当时的情景，艾伦它封印在权杖后，向创始之树的方向飞去，随后旁边出现了庞大的绿色军队。小智走过来向它道歉，鲁卡力欧却微笑着站起来，它想也许小智说的是对的吧，艾伦所以这么也都是为了它好。
大家返回吉普车，但却遭到了岩神柱的攻击。鲁卡力欧掩护大家进入了一条隧道，一直进入创始之树。琪朵的探测器被一个突然出现的红色斑点吞噬，琪朵得知探测器很快会被摧毁，树的防御系统已经全被激活！
在前面的小智听见了皮卡丘的声音，可冰神柱却挡在了小智的前面，鲁卡力欧跳起来打倒它，小智得以返回隧道，与大家进入另一条路，为了寻找喵喵的武藏和小次郎也来到了小智的身旁，他们已经被岩神柱与钢神柱发现了。红色的斑点再次出现，变成精灵的形状将逃在最前面的武藏和小次郎吞噬。小智一行随后赶到，鲁卡利欧用波导弹挡住越来越多的红斑，一个红斑抓住了鲁卡力欧，但是马上就放开，似乎红斑不会吞噬精灵。神柱们从后面追来了，一行人决定分开逃跑，小智和鲁卡利欧去引开神柱。红色的斑点却瞄上了另外一队，并且吞噬了小胜小遥和小刚，小刚与小遥为了不让精灵一起被捉，在最后一刻把它们全部放了出来。
鲁卡力欧和小智来到一个由水晶柱连接的巨大山谷前，并且与皮卡丘成功会合，但鲁卡利欧已经明白将要发生事情的严重性。他们来到一个有巨大的水晶构造的屋子，鲁卡力欧在前边带路，但是却被埋伏着的钢神柱抓住，红色斑点趁机抓住了小智和琪朵。他们各自放出精灵抵抗，但是还是无能为力，眼睁睁地看着两人被吞噬，精灵们痛苦地站在两人消失的周围。挣脱了钢神柱的鲁卡力欧看着这些，也感到后悔不已。
梦幻上前用自己的能量触摸一块水晶。水晶开始发光变绿，红斑变成了绿色，落入了土堆溶解掉了，被吞噬的众人也从地下脱离了出来，三神柱也离开了。但琪朵随后发现有一块水晶变成了红色，感觉不太对劲。突然所有的水晶都变成了红色，梦幻也变得异常的虚弱。整棵树都变得不稳定，如果等到它被完全摧毁，必然会引起一场毁灭世界的灾难！水晶开始变黑并破碎，这个地方以难以置信的速度被破坏。梦幻引导大家来到这棵树的核心房间，但梦幻现在很虚弱，大家不知道如何恢复这棵树。鲁卡力欧看了看旁边的水晶层，里面的人竟然是艾伦！
艾伦被封在水晶里，但他的手套却在一旁。小智在找到了一朵时间之花，它的影象展示了艾伦进来时的情景，凤王变回原形，艾伦开始释放他的“波导”的能量给梦幻，梦幻来到核心开始发动创始之树的能量平息那场战争。影像的最后，艾伦摔倒了，显得异常痛苦。
他们现在知道该做什么了，但这样做会以消耗生命为代价。鲁卡力欧知道自己可以和艾伦一样利用波导的能量，义无反顾地走向梦幻，但却觉察到自己还没有强大到释放出需要的能量。小智想起自己有着和艾伦一样的波长，也可以控制波导的力量，于是戴上了艾伦使用的帮助引导能量的手套。琪朵担心小智这样做的后果，但小智说拯救世界比自己的生命更加重要。鲁卡力欧和小智开始将自己的能量传递给梦幻。时间一点点地流逝，他们感到身体越来越疲惫。就在最后一刻，鲁卡力欧一把将小智推开，把自己最后的能量都传给了梦幻。当能量的引导完成时，梦幻迅速地移动到树的核心，储存能量的散发出一束绿色光芒——就象数百年前的一样。水晶变成了绿色，散发出照耀整个大陆的光芒，拯救了这棵树与这世界的根基。
鲁卡力欧累倒了，和艾伦一样的情形。鲁卡力欧将手伸进一朵时间之花，艾伦出现在它旁边，说完他最后的话，他感谢鲁卡力欧作为他的徒弟总是忠心耿耿，他封印鲁卡力欧，是为了在迫近的危险前保护他的朋友，不是仆人……鲁卡力欧，不是主人的仆人，而是自己的朋友！
鲁卡力欧露出了微笑，它终于理解了艾伦。但自己的时间已经不多了，在生命结束之前，他要感谢小智，是他让它感受到了和艾伦给与他的一样的友谊。鲁卡力欧消失了，随着艾伦化为结晶形态，两个灵魂升上了天空……