基础医学院医学超微结构教研室的前身是湖南医科大学基础医学院电子显微镜室。原电子显微镜镜室成立于1979年5月，1980年首台电镜正式投入使用。1999年元月，学校机构调整划归基础医学院管辖。2001年，为适应医学发展需要及与国内、国际相同专业接轨更名为“医学超微结构教研室”。历任室主任有：彭隆祥、王福熙、曾庆善，现任主任吴晓英。