南京工业大学学生会是校党委领导下的全校大学生群众组织，在校团委的指导帮助下开展工作。本会参加中华全国学联和江苏省学联。本会在校党委的领导下，校团委的指导下独立自主的开展工作。
南京工业大学学生会由主席团、秘书处、新闻宣传中心、文体中心、服务中心、权益中心、社区文化中心、网络中心，浦园组委会等构成。各职能中心及部门为学生会处理日常工作、开展活动的常设职能机构。