根组织
“根”是木叶的一个秘密组织，训练木叶暗部的成员，但不属于暗部，是一个独立的团体，负责暗中保护木叶，但做事比较极端。正如一棵树由根生出一样，这一组织把自己比作支持木叶这棵大树的基本，所以用“根”来命名。“根”目前的首领是团藏，团藏是当初和三代竞争火影的人，与一、二、三代不同，属于强硬派，他不满前几任火影的“懦弱”，领导“根”主张以武力消灭一切潜在的对木叶不利的因素，虽然出发点比较激进，但本质也是为了保护木叶。 根：团藏、佐井、信、风、都练、寺井；
元老团藏
团藏（ダンゾウ）是木叶村鹰派的代表人物。他曾经和三代火影争夺火影的位置。后来，他建立并控制着暗部的训练组织——根。
团藏一向主张用战争、暗杀等强硬手段解决问题，对于初代火影和受初代火影影响的三代火影以及纲手的观点都持不屑的态度。因此尽管他对木叶村忠心耿耿，纲手并不信任他。在天地桥任务中，他安插佐井进入第七班执行秘密任务。他出险棋，让佐井假投降到大蛇丸一边以方便行动。为了达到目的，佐井还把暗部的人员情报都给了大蛇丸。佐井的行动引起了天藏的怀疑。但最后发现，团藏是希望让佐井伺机杀死佐助以防止大蛇丸夺取佐助身体后再次对木叶村不利。任务失败后，在得知佐井并没有按照他的命令行事，他说：“感情带来仇恨，仇恨导致战争。”