RMAP
随机微卫星扩增多态DNA(MAPD)1. RMAPD的原理随机微卫星扩增多态DNA(RMAPD)是2005年蓝贤勇等在RAPD和微卫星(SSR)的基础上发展起来的一种检测DNA多态性的新方法。它利用随机引物和微卫星的上游或下游引物一起作为该扩增的引物,在TaqDNA聚合酶、Mgc12和模板DNA等共同作用下进行PCR扩增的一种分子标记方法。其核心是RMAPD引物的有效性问题。蓝贤勇等通过对西农萨能奶山羊群体RMAPD电泳检测、数据统计分析及验证实验等证明RMAPD的引物是有效的。通过与微卫星和RAPD标记比较,发现RMAPD标记在扩增引物、扩增程序和重复性等方面区别于微卫星和RMAPD标记;它是RAPD标记的一种广义的延伸,但又不完全等同于RAPD标记。因此确定RMAPD是一种新的分子标记方法。该方法也具有DNA标记的特点,在群体遗传结构和亲缘关系分析以及标记辅助选择等动物遗传育种领域具有广阔的应用前景。
2 .RMAPD作为一种新型分子标记的探讨由于RMAPD标记方法中含有随机引物,故认为能影响RAPD的因素也可能影响RMAPD。陈宏等指出引物的种类、长度、浓度、DNA的质量和浓度、扩增条件和操作技术等对RMAPD结果有影响,说明在进行生物遗传分析时必须进行RMAPD方法的优化和标准化,这样才能够得到可靠、稳定的结果。蓝贤勇等对西农萨能奶山羊群体RMAPD的研究表明,西农萨能奶山羊血样DNA的质量非常好,并对DNA样品进行了纯化,为RMAPD分析结果的可靠性提供了坚实的基础。该实验所用RMAPD程序参考RAPD程序,所用RMAPD体系参考RAPD体系的正交实验结果后的第2次正交实验数据,这为实验结果的可靠性提供了良好的保证。RMAPD的核心是RMAPD引物的有效性问题。