卫生资源配置是指政府或市场如何使卫生资源公平且有效率地在不同的领域、地区、部门、项目、人群中分配，从而实现卫生资源的社会和经济效益最大化。卫生资源的配置应包括卫生资源的增量与卫生资源的存量调整两个方面。
卫生资源的增量配置，又称为初配置，如当年计划投入的卫生经费等
卫生资源的存量调整又称为存量再分配，是指通过对原有卫生资源的重新分配改变分配不合理的现状，达到优化的目的