呼吸电子传递链
呼吸电子传递链（respiratory electron-transport chain）：由一系列可作为电子载体的酶复合体和辅助因子构成，可将来自还原型辅酶或底物的电子传递给有氧代谢的最终的电子受体分子氧。
葡萄糖代谢中的大部分能量的释放靠包括分子氧在内的电子传递系统或电子传递链来完成。
电子传递链：存在于线粒体内膜上的一系列电子传递体，如FMN、CoQ和各种细胞色素等，分子氧是电子传递链中最后的电子受体。
在电子传递链中，各电子传递体的氧化还原反应从高能水平向低能水平顺序传递，在传递过程中释放的能通过磷酸化而被储存到ATP中，ATP的形成发生在线粒体内膜上。
复合体 IV (亦即细胞色素氧化酶) 是呼吸电子传递链上的最后一个酵素,包含 13 种蛋白质,其中有 3 个蛋白质是由粒线体 DNA 编译而来.这 3 个由粒线体 DNA 控制的蛋白质是复合体 IV 中的催化部位,实际执行电子传递的功能.
氧化磷酸化（oxidative phosphorylation）：电子从一个底物传递给分子氧的氧化与酶催化的由ＡＤＰ和Ｐi生成ＡＴＰ与磷酸化相偶联的过程。磷酸化作用是和氧化过程的电子传递紧密相关的。与底物水平磷酸化不同。
氧化磷酸化机制
1961年，P.Mitchell提出化学渗透学说（chemiosmosis）,1978年获得诺贝尔奖。
化学渗透理论（chemiosnotic theory）：一种学说，主要论点是底物氧化期间建立的质子浓度梯度提供了驱动ＡＤＰ和ＡＴＰ和Ｐi形成ＡＴＰ的能量。
要点：电子传递链位于线粒体的内膜上，电子传递体顺序排列在线粒体的内膜上，其中很多电子传递体和线粒体内膜上的蛋白质紧密结合形成3个电子传递体和蛋白质的复合体。这3个复合体在线粒体内膜上的地位是固定的。除传递电子外，还起着质子泵的作用，将质子泵入膜间腔中，使得在膜间腔和基质之间形成一个电化学梯度，膜间腔内的质子通过ATP合成酶复合体进入基质，释放的能量用来合成ATP。每两个质子穿过线粒体内膜所释放的能可合成1个ATP分子。
一个NADH分子经过电子传递链后，可积累6个质子，可生成3个ATP，而一个FADH2分子只可生成2个ATP分子。
包括一个质子通过有选择性透性的线粒体内膜的过程，又包括一个化学合成，即ADP—>ATP的过程。
叶绿体也是通过化学渗透来合成ATP的。