福州同济门诊部组建于二十世纪八十年代，其前身（蓝天医学门诊部）是一所军队医疗机构，由卫生协会组织有军内外医学专家加盟的一所以特色专科为主的，集医学研究、健康咨询、预防治疗为一体的专业医疗机构。
福州同济门诊部拥有神经内科、内分泌内科、心血管内科、泌尿外科、肛肠外科、五官科、口腔科、妇科、中医科、皮肤科及辅助临床科室。