异常剪接

对序列库中异常剪接mRNA的鉴定和分析

本文设计了一套策略：来找出数据库中存在的chromosome translocation、mRNA trans-splicing、multi-locus transcription、antisense transcription等异常剪接的mRNA 。

一方面自然潜在的这种异常剪接方式有重要的生物学作用。比如chromosome translocation可以下调某种基因的表达或者产生致癌基因，诱导癌细胞的生长选择优势；反式剪接的主要功能是处理多顺反子性转录单元，调控转录效率和mRNA的稳定性，同时可以增加产物蛋白的多样性。antisense transcription众所周知有下调某基因表达的作用。所以鉴定出目前数据库存在的这些异常剪接mRNA有重要的功能意义。

另一方面，由于试验中的错误联配和反向转录，会造成许多人为的异常剪接情况，比如嵌套基因、基因组污染等。这些序列必须从库中遴选出改正或抛弃。

本文重要的借鉴意义在于它的策略流程：如下图：

每一条过滤规则都有其意义，需深入理解