萧砀县是解放初期临时成立的一个县，是由原有的萧县和砀山县合并临时成立的。
1959 年 3 月22 日，国务院决定，撤销萧县、砀山 2个县，设立萧砀县；1961年4月7日，萧砀县改属宿县专区。1961 年12月15日，国务院决定，撤销萧砀县，恢复萧县、砀山县，并没有影响今县域。存在期间，萧砀县相当于今萧县和砀山县2 个县的总面积，划开后又恢复旧域，仍属宿县专区。