多样性序列芯片技术

多样性序列芯片技术(Diversity Arrays Technology ,DArT )是Andrzej Kilian于2001年发明的一种新型分子标记技术,它是通过与芯片杂交的技术来辨别不同基因组之间多态性的方法,具有标记质量高、高通量、低成本、不需已知序列信息等优点,在农作物分子标记辅助育种等方面具有广阔的应用前景

DArT技术检测的是基因组DNA经限制性内切酶酶切后形成的特异DNA片段具有的多态性。

DArT技术的基本原理:首先降低基因组DNA的复杂性,一般是用两种不同切割频率的限制性内切酶酶切,酶切片段连接其中切割频率低的限制性内切酶识别序列的接头(图1),扩增连接产物,得到基因组代表性片段。由于不同来源的基因组DNA特定的限制性内切酶酶切位点分布不同,每一种不同来源的DNA被限制性内切酶酶切后产生的片段都是特异的,从而产生多态性。

DArT技术的主要步骤:使用特定的基因组复杂性降低方法产生基因组代表性片段;构建DArT文库;芯片的制备;待测样品的制备;待测样品与芯片杂交;信号扫描及数据处理。