安琪酵母(睢县)有限公司成立于2005年，是由安琪酵母股份有限公司与安琪酵母(伊犁)有限公司共同出资成立。
在睢县县委、县政府的大力支持下，安琪酵母(睢县)有限公司在成立之后，对原有生产线进行第一次了技术改造，并于2005年3月18日投产。
2005年10月，公司进行了第二次技术改造，于2006年2月顺利投产。