持明院统是指镰仓时代后期日本南北朝时代的后深草上皇系统、也就是第88代后嵯峨天皇之子与第89代后深草天皇的子孙。
持明院统历代天皇后深草天皇（89代）伏见天皇（92代）后伏见天皇（93代）花园天皇（95代）光严天皇（北朝1代）光明天皇（北朝2代）崇光天皇（北朝3代）后光严天皇（北朝4代）后圆融天皇（北朝5代）后小松天皇（北朝6代・100代）称光天皇（101代）