为提高行政效率，国防最高委员会从1940年开始推行行政三联制，即按照行政运行的顺序，把一切工作过程分为计划（中央设计局）、执行（党政军原有机关）、考核（党政工作考核委员会）三个阶段。国防最高委员会是将三者统一起来的最高指挥机关。