由自然演变和自然灾害引起的环境问题叫做原生环境问题，也叫第一环境问题。原生环境问题是自然环境本身发展演变而引起的。原生环境问题主要有：火山爆发、地震、海啸、洪涝、干旱、台风、崩塌、滑坡、泥石流，以及区域自然环境质量恶劣所引起的地方病等。
这一类环境问题在人类社会出现以前就存在于自然界中，而且一般不能为所预见和预防。