核仁小RNA，是近来生物学研究的热点，由内含子编码。已证明有多种功能，反义snoRNA指导rRNA核糖甲基化。
核仁小RNA与其它RNA的处理和修饰有关，如核糖体和剪接体核小RNA、gRNA等。核仁小RNA是一个与特性化的非编码RNA相关的大家族。