梅花鹿的一种，仅栖息在庆良间列岛的屋嘉此、庆留间、阿嘉和座间味四岛。这些岛屿断崖多，地形复杂，崖下可见琉球梅花鹿的骨骸，意外坠死的例子似乎不少。而且岛上几乎无河川，饮水不足也是致命的影响之一。个体数估计仅50至70头，但阿嘉岛上曾有人目击它们在人类居住地附近觅食，于是农作物被糟蹋成为一大隐忧。