中性理论（neutral theory） 分子进化的重要理论之一。更确切地应称为中性突变与随机漂移理论（neutral mutation and random genetic drift）。其核心为：大部分对种群的遗传结构与进化有贡献的分子突变在自然选择的意义上都是中性或近中性的，因而自然选择对这些突变并不起作用；中性突变的进化是通过随机漂移，或被固定在种群中，或消失。