启动磁区型病毒会感染磁碟的启动磁区或分割区表格。电脑系统最容易受到启动磁区型病毒攻击，如果您使用中毒的磁片开机的话 --
即使开机不成功也会使病毒感染硬碟。另外，有少数病毒可以从执行档感染启动磁区 -- 这些病毒称为复合式病毒，但不多见。系统一旦感染后，启动磁区型病毒会企图感染该电脑上使用的每一个磁碟。通常，磁区型病毒大部份都可以完全清除。