国务院学位委员会办公室是国务院学位委员会的日常办事机构，统筹规划并归口管理全国的学位与研究生教育工作，设在教育部，与教育部研究生工作办公室、教育部学位办公室、“211工程”办公室合署办公，同时承担《亚太地区相互承认高等教育学历、文凭、学位公约》中国国家级执行机构的工作。
下设职能处6个:行政秘书处、文理医学科处、工农学科处、质量监督与信息处、重点建设处、综合处。