在纯合子胱硫醚β合成酶缺乏时,血浆半胱氨酸水平可增高10倍或更多.这些患者是动脉或静脉血栓栓塞的高危人群,高半胱氨酸血症与动脉粥样硬化之间存在强相关性.杂合子胱硫醚β合成酶缺乏和叶酸代谢异常(包括甲基4氢叶酸脱氢酶缺乏)可引发轻型病例.在饮食中补充叶酸可使半胱氨酸水平恢复正常,但此举未使血栓形成的危险率降低.