NRDB

王朝百科·作者佚名  2010-02-06  
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NRDB是由NCBI创建的,是NCBI的BLAST搜索程序的默认蛋白质序列数据库。该数据库由GenPept(由GenBank 编码序列自动翻译而成数据库)、PDB序列数据库、SWISS-PROT数据库、SPupdate(每周更新的SWISS-PROT数据库)、PIR和GenPeptUpdate(每天更新的GenPept)数据库复合而成。因此该数据库是一个较完全的,包含最新信息的数据库。该数据库中已将那些与某一序列完全相同的序列信息剔除, 因此不包含重复信息。但严格地说,尽管NRDB数据库被称作非冗余数据库,其仍包含冗余信息。此外,由于该数据库是通过简单的比较方法生成的,因此会带来一些问题,例如,一次数据库中的错误序列被引入该数据库。

 
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