隐藏型原噬菌体 cryptic prophage 因基因缺失和突变，使原噬菌体丧失一个或数个为溶菌生殖必需的功能的缺陷型原噬菌体中，特别是与合成阻遏物有关的部位不完全从而不显示免疫性的称为隐藏型原噬菌体。在有原噬菌体存在时，普遍都表现有免疫性，并能产生噬菌体。缺乏这二种性能的细菌外观上很像是非溶原菌，但有时具有这种缺陷型原噬菌体。