古代境内居住着印第安人。公元１１世纪，印第安人以库斯科城为首府，在高原地区建立了“印加帝国”。１５－１６世纪初形成美洲的古代文明之一─印加文明。１５３３年沦为西班牙殖民地。１５３５年建立利马城，１５４４年成立秘鲁总督区，成为西班牙在南美殖民统治的中心。１８２１年７月２８日宣布独立，建立秘鲁共和国。１８３５年玻利维亚和秘鲁合并，称秘鲁—玻利维亚邦联。