巴特肯州成立于1999年10月13日，原为奥什州的一部分，下辖3个区、4个市、5个镇和3个村。面积1．7万平方公里，人口40万(2003年1月1日)。
该州位于吉尔吉斯斯坦共和国西南部。西和西北与塔吉克斯坦交界，北与乌兹别克斯坦接壤，其3／4的州界线为国界线。州首府巴特肯市，原为巴特肯区的区中心，1999年3月有人口1．1万人。