肺真菌病的发病可分为原发吸入感染和条件致病两大类。后者常继发感染于严重疾病的末期，长期应用抗生素、激素、细胞毒性药物，使人体内菌群失调，机体免疫功能低下者。肺真菌病的病理组织学改变主要为渗，出性组织坏死，脓肿形成，化脓性肉芽肿或结核样肉芽肿等。