它是一种水溶性的蛋白，主要起着介导合成的磷脂由内质网向其他膜的转运。首先，磷脂转换蛋白与磷脂分子结合形成水溶性复合物进入细胞质基质，通过自由扩散，直至遇到靶膜时，磷脂转换蛋白将磷脂释放出来，并安插在膜上，结果是磷脂从含量高的膜转移到缺少磷脂的膜上。