通过用限制性内切酶消化和与特异的核心探针杂交取得不同大小的DNA片段的多点区带图谱，并经与另一个休的DNA图谱比较以评价其相似性的技术。对多点带图谱中个体的特异性进行评价的方法被称为“DNA指纹图谱法”。该法是根据没有两个无亲缘关系的个体在同一位置上共有同相同的区带图谱的机率极低，所以DNA指纹图被认为对某一个体是独特的。这种技术已广泛地应用地法医和亲子鉴定。