RAKE

RAKE

即RNA-primed ，array-based Klenow enzyme assay 简称.是Nelson 等人在基因芯片基础上发展出的一种新型RNA序列分析技术。该方法是设计 包含了和miRNA反义序列及通用的间隔序列的DNA寡核苷酸探针。当miRNA和探针结合时，在加入了Klenow enzyme 后miRNA作为引物进行延伸，并且产生和掺入的标记核苷酸构成的双链片段，而容易被检测。这个方法在两个相关的miRNA需要被分别分析的时候尤其适用，因为3'端错配的miRNA不能够延伸。该技术能够在特定的细胞和肿瘤中同时检测所有的 miRNA 的表达图谱。

【参考】Nelson, P.T. et al. (2004) Microarray-based, high-throughput gene expression profiling of microRNAs. Nat. Methods 1, 155–161