疫苗注射
疫苗注射是将具有病原性的疫苗制剂注入到健康人体或动物身上，使接受方获得抵抗某一特定疾病原的免疫力。藉由免疫系统对外来物的辨认，进行抗体的筛选和制造，以产生对抗该病原或相似病原的抗体，进而使受注射者对该疾病具有较强的抵抗能力。今日医学上亦将此过程称为接种，但就疫苗注射的发展过程，接种乃是由种痘技术而来，其本意与今日用法有所不同，在现代免疫学研究的运用范畴也有些微差距。
历史
目前已知最早使用的疫苗注射可溯源至种痘（variolisation）技术，这项技术可能起源自中国文明。清代医书认为，十一世纪起，中国人于北宋时期即开始种天花痘[1]，而另一本医书则记载，更早于唐代即有“江南赵氏始传鼻苗种痘之法”，且“种痘者八、九千人，其莫救者，二、三十耳。”显示该技术对天花的预防颇有成效[2]，而据推测可能使用的是毒性较低的天花，使欲免疫天花之受试者接触患者的脓状囊疱，但此做法无法确保有效，且风险仍高，死亡率达1~2%，随后这项技术沿丝路传播开来。十八世纪初种痘技术由君士坦丁堡引入西方。1760年，丹尼尔·伯努利成功地让世人发现，尽管种痘技术有其危险，仍能为一般平均余命（life expectancy）延长三年。
英国医师爱德华·金纳听闻民间普遍相信牛痘可以预防人类天花，因感到好奇的他，于1796年5月14日对一名儿童接种由感染牛痘的农妇手中抽取的脓汁作为疫苗，三个月后，他将天花接种至儿童身上，并证实该名儿童对天花免疫，这个方法因此传遍整个欧洲，因此在使用拉丁字母的语言中，皆以拉丁文中，代表“牛”的“vacca”作为字源，纪念爱德华·金纳使用牛痘作为疫苗实验的里程碑。
路易·巴斯德并进一步阐释接种的意义和目的，而其同事（Émile Roux及Duclaux）顺著罗伯·柯霍提出的假说，将微生物和该疾病的关系确立。这项发现使巴斯德得以改良接种技术，随后于1881年5月5日成功研发绵羊的霍乱疫苗，并于1885年6月6日让一位儿童接受狂牛病的疫苗注射。倘若不以“疫苗”的初始定义来看，这便是人类史上第一剂疫苗。
目的
疫苗注射通常打在肩膀上的三角肌，图为美国海军进行疫苗注射一景注射疫苗的主要目的是使身体能够制造自然的生物物质，用以提升生物体的对病原的辨认和防御功能，有时类似的病原体可以引起针对同一类病原的免疫反应，因此一个疫苗主要是针对一个疾病，或相似度极高的病原体，例如以牛痘预防天花即为佳例。但二十世纪末开始，免疫学家发现疫苗也有治疗的可能性，并发展出相关的研究理论和实际用途。
预防
注射疫苗多数时候是一种可以激起个体自然防御机制的医疗行为，以预防未来可能得到的疾病，这种疫苗注射特称为预防接种。白喉、破伤风、百日咳、小儿麻痹、B型流感嗜血杆菌、乙型肝炎、结核（预防结核病的卡介苗效果仍未获得学界一致认同，因此美国、比利时和荷兰都未采用此疫苗。）、痳疹、德国麻疹、腮腺炎，都是目前最常见的疫苗种类。由于需要以疫苗防范的疾病非常多，因此为简化繁复的注射程序，有些实验室致力发展多效疫苗，而目前已经使用的至少有“白喉、破伤风、百日咳混合疫苗”（Di-Te-Per）以及“麻疹、腮腺炎、德国麻疹混合疫苗”（MMR）。由于并非所有疫苗都可同时施打，因此新生儿需接受的疫苗种类仍相当繁琐。
疫苗不仅可以使接种者罹患该疾病的发生率下降，当一种疫苗所对付之疾病仅感染单一物种时，要消灭病原便有其可行性，例如天花在自然界仅感染人类，当几乎所有人都接种疫苗后，天花无法继续传播，亦无法于其他动物之间蔓延，因此于1980年联合国宣布天花的灭绝，以及1999年第二型的小儿麻痹亦不复存在。因此逐渐有许多国家取消相关疫苗的注射，也使得未接种疫苗的个体可能在未来受到生物战争的威胁。
治疗
疫苗也可以用来做积极的免疫治疗，这种技术刺激免疫系统大量制作抗体，或是以外来的相应抗体，共同来对付已经感染之患者体内存有的病原，狂犬病疫苗即是运用此原理，同时这种疫苗也可能用作预防性疫苗。而近年对癌症以及艾滋病的研究发现，病变的细胞和一般细胞表面有不同的标记，可能适合作为抗体攻击的目标，用以治疗患者。
疫苗种类
主条目：疫苗
疫苗的制作可以经由化学合成，由特定的蛋白质为引，制作出微妙的变化型态，使其能够与淋巴球进行生化反应，影响抗体的制造；但它也可以是直接透过生物体制造的产物，以活体的病原为起始，藉由实验控制的特殊环境下使其复制，或是使用死去的病原作为诱引，可以在不伤害其他细胞的情况下只刺激淋巴球。尽管一般认为活体疫苗的效果较好，但相对也较不易保存。因为涉及基因工程，引发研究伦理的问题，目前化学合成的疫苗则较为少用。
传统疫苗
去活性疫苗——透过热或化学药剂将致病微生物结构破坏或将其杀死，但因部分结构仍完整，可诱起免疫反应达到疫苗注射之目的，如流感、霍乱、腺鼠疫、甲型肝炎，但由于毒性较低、时效短、无法引起完整的反应，有时必须追加施打。
活体减毒疫苗——利用培养技术制造出的活体微生物，在制程中利用添加化学药剂、改变遗传物质、或是施以物理变化，以得到减低或去除毒性的品种。由于免疫反应主要侦测的是病菌本身外部的构造，因此减去毒性物质或微生物代谢产物仍可有效产生施打疫苗者的免疫力。例如：黄热病、痳疹、腮腺炎疫苗。活体结核疫苗是以不具传染性的结核菌株（strain）所制，但卡介苗在美国却鲜少使用。
类毒素疫苗——某些微生物本身无害，但其产生、释放之毒素是疾病的根源，部分科学家将此类毒素改造或破坏以达到免疫反应所需的基本诱发功能，却不伤害接种者，例如破伤风和白喉疫苗。
次单元疫苗——有些毒素或微生物只需利用部分结构即可引发免疫反应，例如乙型肝炎疫苗仅含有该种病毒的表面蛋白质。
新式疫苗
结合疫苗——利用细菌表面多醣结构，有时这些结构对免疫系统的辨识上效果不佳，藉由将这层结构连结上许多特殊物质，例如特殊结构的蛋白质、毒素或醣类，可以增进免疫系统的判断力，这种方式已成功用在B型流感嗜血杆菌疫苗。
基因重组载体疫苗——以微生物的生理运作为基础，配合其他物种微生物的DNA，这种方式研发出的疫苗，可能对感染过程复杂的疾病有所帮助。例如将细菌的DNA切成片段，组合至酵母菌的染色体中，利用酵母菌制作该片段之细菌蛋白质作为疫苗，可免除致病细菌对人体的实质伤害，达到免疫效果。
DNA疫苗——对目标细胞，藉由改造过的病毒或细菌感染，以插入基因或调节基因表现（gene expression）的手法，引起免疫系统的活化，若这些细胞因此在表面呈现异于接种者本身的物质，将会被免疫系统辨识后受到攻击，尽管此项技术仍在试验中，却有可能成为未来治疗癌症、遗传疾病的重要疗法。