喀喇汗朝
喀喇汗朝是主要由一支西迁的回纥部众建立起来的。据穆斯林作家记载，喀喇汗朝的第一位可汗是毗伽阙·卡迪尔汗。他建都于巴拉沙衮附近的虎思斡尔多（今吉尔吉斯斯坦托克马克以东楚尔河南岸）。在卡迪尔汗死后，汗位由二子继承，实行双汗制。长子巴斯尔为大汗，又称阿尔斯兰汗，治巴拉沙衮；次子奥古尔恰克，为卡迪尔汗，即副汗，治怛罗斯。其最初的疆域大约包括伊犁河流域、阿姆河以北，东面到喀什噶尔，与于阗和西州回鹘相邻，西面到巴尔喀什湖和锡尔河、阿姆河中游。
10世纪初，喀喇汗朝发生一件大事，是伊斯兰教的传入。据说奥古尔恰克的侄子——撒图克首先皈依了伊斯兰教。后其击败了奥古尔恰克，夺取了东部喀喇汗朝的政权，成为布拉格汗，接着他又统一了喀喇汗国，将伊斯兰教推行到全国。在他儿子继位期间，伊斯兰教成为喀喇汗朝的国教。
在撒图克孙子哈桑在位期间（约10世纪最后十多年），喀喇汗朝再向于阗发起进攻的同时，向西扩展领土，曾攻占了撒曼王朝的首都布哈拉、中亚名城撒马尔罕，给撒曼王朝以沉重的打击。
到了十一世纪初，喀喇汗朝越过阿姆河，与当地的伽色尼王朝发生战争，双方僵持不下，最后只得各自停止了战争。这次战争大大削弱了喀喇汗朝的实力，同时也加剧了王朝内部统治者的矛盾。1040年贝里特勤易卜拉欣自称桃花石伯格喀喇汗，并以撒马尔罕为首都建立了西喀喇汗朝。而阿尔斯兰汗统辖的区域则称之为东喀喇汗朝。两朝多次战争消弱了各自的力量。
1128年，东部喀喇汗朝的阿尔斯兰汗阿赫马德死，其子易卜拉欣即位，境内的葛逻禄人和康里人发动了反对他的起义，易卜拉欣竟然喊西辽国军耶律大石前来帮助。耶律大石乘机吞并了东喀喇汗朝（成为西辽的附属），并继续西进，于1141年粉碎了赛尔驻苏丹的援军，西喀喇汗朝也成为西辽的附属。
13世纪初，成吉思汗击败乃蛮部，乃蛮部太阳汗之子屈出律于1208年逃入西辽，不久便夺去了西辽政权，并最终消灭了名存实亡的东喀喇汗朝。13世纪初，于西喀喇汗朝为邻的花剌子模部强大起来，并摆脱了西辽的统治，并征服了河中地区。1212年，花剌子模乘西喀喇汗朝通知内乱，灭了喀喇汗朝。
卡拉汉朝为吃了两百多年灭亡。但是随着政权的灭亡，回纥人又面临一次新的民族融合，并最终于西州境内的回纥人一起，为维吾尔族的形成，做出了重大贡献。